Η ιδέα της ίδρυσης ενός νοσοκομείου αποκλειστικά για παιδιά δημιουργήθηκε στο τέλος του 19ου αιώνα από την πριγκίπισσα Σοφία και μια ομάδα επιφανών Αθηναίων. Το έργο ξεκίνησε το 1896 και το πρώτο παιδί προσήλθε για νοσηλεία στο Nοσοκομείο Παίδων «Η Αγία Σοφία» την 1η Απριλίου 1900. Σκοπός του Νοσοκομείου ήταν η νοσηλεία παιδιών μέχρι 10 ετών, δωρεάν για τα άπορα και επί πληρωμή για τα εύπορα, καθώς και η εκπαίδευση γυναικών ως νοσοκόμων. Μέχρι σήμερα το Γ.Ν.Π. «Αγία Σοφία» έχει περιθάλψει χιλιάδες παιδιών, ισότιμα και ανεξάρτητα από την οικονομική και κοινωνική κατάστασή τους. Αναγνωρίζοντας τον νευραλγικό ρόλο του στην περίθαλψη, την πρόληψη και την προαγωγή της ιατρικής έρευνας για το Παιδί, η ΑΙΓΕΑΣ ΑΜΚΕ με τις δωρεές της έχει συμβάλει στην αναβάθμιση των υποδομών και του ιατροτεχνολογικού εξοπλισμού του Νοσοκομείου.
Η Μονάδα Αιμόστασης και Θρόμβωσης του «Αγία Σοφία» ιδρύθηκε το 1975. Είναι αναγνωρισμένο Κέντρο Αιμορροφιλίας για παιδιά και εφήβους- το μεγαλύτερο στην Ελλάδα και ένα από τα μεγαλύτερα στην Ευρώπη. Περισσότερα από 800 παιδιά και έφηβοι παρακολουθούνται σε τακτική βάση, ενώ στο εργαστήριο της Μονάδας πραγματοποιούνται ετησίως περί τις 60.000 εξετάσεις. Παράλληλα, το Κέντρο διενεργεί προγεννητικό έλεγχο για γυναίκες φορείς της αιμορροφιλίας, προσφέροντας και εξειδικευμένη συμβουλευτική. Ενώ όμως τα τελευταία χρόνια η ανίχνευση των μεταλλάξεων γονιδίων σε επίπεδο προγεννητικού ελέγχου είναι απαραίτητη για την αποφυγή μελλοντικής γέννησης παιδιού με βαριά αιμορροφιλία- συχνά απειλητική για τη ζωή του- η Μονάδα δεν διέθετε μέχρι πρότινος δικό της Γενετικό Αναλυτή Sequencer- το εξειδικευμένο μηχάνημα για την ανίχνευση των μεταλλάξεων. Η ΑΙΓΕΑΣ ΑΜΚΕ, ανταποκρινόμενη στο αίτημα του Νοσοκομείου, έχει συμβάλει στην αναβάθμιση των υποδομών της Μονάδας, με τη δωρεά του Αναλυτή, καθώς και των απαραίτητων αναλώσιμων για πέντε έτη. Η απόκτηση του μηχανήματος έχει αυξήσει σημαντικά τον αριθμό των εργαστηριακών ελέγχων, μειώνοντας τις καθυστερήσεις και ενισχύοντας τη δυνατότητα έγκαιρης διάγνωσης και πρόληψης.
Το «Ειδικό Κέντρο Αντιμετώπισης Συγγενών Καρδιοπαθειών στα Παιδιά» (Ε.Κ.Α.Σ.ΚΑ.Π.) είναι το πρώτο Παιδοκαρδιοχειρουργικό Κέντρο που λειτούργησε στην Ελλάδα, το 1986, και το μοναδικό μέχρι σήμερα που διαθέτει το Εθνικό Σύστημα Υγείας, μέσα σε Παιδιατρικό Νοσοκομείο. Κάθε χρόνο στο Κέντρο εξετάζονται περισσότερα από 7.500 παιδιά, ασφαλισμένα και μη. Στο Αιμοδυναμικό Εργαστήριο του Κέντρου πραγματοποιούνται όλων των τύπων διαγνωστικοί αλλά και θεραπευτικοί-επεμβατικοί καθετηριασμοί σε νεογνά, βρέφη, αλλά και μεγαλύτερα παιδιά. Η ΑΙΓΕΑΣ ΑΜΚΕ, με ιδιαίτερη ευαισθησία για την υγειονομική περίθαλψη και την προστασία των παιδιών, ανέλαβε την ανακαίνιση των χώρων του Αιμοδυναμικού Εργαστηρίου του Ε.Κ.Α.Σ.ΚΑ.Π., η οποία ήταν απαραίτητη για τη διασφάλιση της απρόσκοπτης λειτουργίας του. Το Εργαστήριο το 2023 απέκτησε έναν τελευταίας τεχνολογίας Ψηφιακό Αγγειογράφο. Ωστόσο, για την αποτελεσματικότερη αξιοποίηση του μηχανήματος, κρίθηκε απαραίτητη η ανακαίνιση των υπόλοιπων χώρων του Εργαστηρίου, συνολικής έκτασης περίπου 450 τ.μ. Αυτοί περιλαμβάνουν τον χώρο υποδοχής και αναμονής, τους χώρους υπερηχοκαρδιογράφων, την αίθουσα ανάνηψης, την αίθουσα ανάλυσης Holter 24ωρης ηλεκτροκαρδιογραφήματος, τον χώρο εκτέλεσης απλής και αναπνευστικής κόπωσης, τα ιατρεία, την αίθουσα συσκέψεων και σεμιναρίων, καθώς και τους βοηθητικούς χώρους όπως wc, αποδυτήρια, κουζίνα και αποθήκη υλικών. Η ανακαίνιση ήταν επιτακτική, αφενός λόγω της φθοράς που είχαν υποστεί οι χώροι μετά από 35 και πλέον χρόνια λειτουργίας, αφετέρου εξαιτίας της ανάγκης αναδιαμόρφωσης για την εγκατάσταση του νέου Αγγειογράφου και της αύξησης του αριθμού των περιστατικών που δέχεται το Κέντρο.
Μετά την εκπόνηση των απαραίτητων μελετών, οι εργασίες ανακαίνισης επικεντρώθηκαν στη ριζική αισθητική και λειτουργική αναβάθμιση του Εργαστηρίου. Στο πλαίσιο αυτό, πραγματοποιήθηκαν και μικρής κλίμακας αλλαγές στη διαρρύθμιση (διεύρυνση του χώρου αναμονής που ήταν ανεπαρκής, δημιουργία περισσότερων χώρων υγιεινής). Επιπρόσθετα, έγινε αντικατάσταση όλων των ηλεκτρομηχανολογικών δικτύων που τροφοδοτούν την αίθουσα του Αγγειογράφου. Επιπλέον, έγινε προμήθεια του απαραίτητου ιατροτεχνολογικού εξοπλισμού για τους χώρους των Υπερήχων, της Ανάνηψης και του Καθαρισμού, όπως φορεία ασθενών, νοσοκομειακά κομοδίνα, monitors παρακολούθησης αρτηριακής πίεσης και καρδιακού ρυθμού, παλμικά οξύμετρα, τροχήλατα νοσηλείας φαρμάκων, συσκευές πλύσης και απολύμανσης υποδημάτων χειρουργείου, καθώς και κυλιόμενα συστήματα μεταφοράς οριζόντιας σανίδας. Παράλληλα, και του απαραίτητου ξενοδοχειακού εξοπλισμού για όλους τους χώρους.